公司补交社保滞纳金按每日万分之五计算。依据《社会保险法》，未按时缴费将被加收滞纳金，长期欠缴可能导致法律纠纷及高额费用。
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补交社保滞纳金需依法处理。操作如下：1. 查询欠缴金额与时间；2. 按每日万分之五计算滞纳金；3. 及时向社保机构补缴，避免法律纠纷。
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处理公司补交社保滞纳金，常见方式为咨询社保机构明确金额后缴纳。选择时，需考虑滞纳金数额与缴纳期限，避免进一步法律后果。