专利代理合同印花税依合同类型定，一般为万分之三或万分之五。依据《印花税暂行条例》，专利权转让等适用产权转移书据税目，税率万分之五；专利申请权转让等适用技术合同税目，税率万分之三。不及时缴纳可能导致税务违法，影响企业信誉及经济利益。
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专利代理合同印花税缴纳方式需依合同性质确定。对于明确价格的合同，按万分之三税率缴纳；属技术转让范畴的，如专利权转让按万分之五，专利申请权转让则按万分之三缴纳。选择时需根据合同具体类型判断。
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专利代理合同印花税依情况缴。1.合同有明确价格，按总金额万分之三缴；2.专利权转让合同，按所载金额万分之五贴花；3.专利申请权转让合同，按所载金额万分之三贴花；4.非专利技术转让合同，同样按万分之三税率缴纳。