2003年宅基地买卖协议依法成立即有效。依据《民法典》，合同成立时生效，登记非生效前提，但影响物权变动。不及时处理可能导致物权无法确认，产生纠纷。
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宅基地买卖协议问题。操作方式：1. 协商解决，双方按协议内容履行，如有争议，友好协商调整；2. 诉讼解决，协议无法履行或存在纠纷，向法院起诉，依据《民法典》判决。
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处理宅基地买卖协议问题，常见方式有协商、诉讼等。应根据协议内容、双方意愿及实际情况选择，协商不成可考虑诉讼解决。